Uzman Diş Tabibi Hasip ALTINSEL tarafından 07 Şubat 1966 tarihinde Gülhane Askeri Tıp Akademisi Odontoloji Enstitüsü’ne bağlı olarak Ortodonti Seksiyonu adıyla kurulmuştur. 1968 yılında doçent ünvanı alan Hasip ALTINSEL, 1972 yılına kadar Ortodonti Seksiyonu direktör vekilliğini yürütmüştür.

Hasip ALTINSEL’in vefatından sonra 1972-1974 yılları arasında direktör vekilliğini Prof. Dr. Sadun UZEL yürütmüştür. Diş Tabibi Ertuğrul ERDOĞAN 1974 yılında doçentliğe atanmasından sonra direktör vekilliği görevine getirilmiştir.

17 Kasım 1983 tarihinde yürürlüğe giren GATA Kanunu ile birlikte Sağlık Bilimleri Enstitüsü kurulmuş ve Odontoloji Enstitüsü, Dişhekimliği Bilimleri Merkezi olarak Sağlık Bilimleri Enstitüsüne bağlanmıştır. Bu yeni akademik düzenlemede, Ortodonti Seksiyonu da Dişhekimliği Bilimleri Merkezi Başkanlığı’na bağlanarak, Ortodonti Anabilim Dalı kimliğiyle çalışmalarını yürütmeye devam etmiştir.

1998 yılında Prof. Diş Tbp. Kd Alb. Ertuğrul ERDOĞAN’dan boşalan Ortodonti Anabilim Dalı Başkanlığı’na Prof. Diş Tbp. Tuğg. Yalçın IŞIMER atanmıştır.

Kurulduğu günden beri TSK’ne 50 nin üzerinde ortodonti uzmanı yetiştiren Ortodonti anabilimdalı’nda 9 Diş Tabibi öğretim üyeliğine yükselmiştir. Halen bilimsel faaliyetler ve poliklinik çalışmaları 1 profesör, 3 doçent, 1 yardımcı doçent ve 6 doktora öğrencisi ile sürdürülmektedir.

Ortodonti Anabilimdalı Başkanlığı, 30 Ağustos 2003 tarihinden itibaren Prof. Dz.Diş Tbp. Kd Alb. Deniz SAĞDIÇ tarafından yürütülmektedir.